Альтернаріоз на посівах пшениці виявляється в період цвітіння рослин і молочної спілості зерна у виді темних плям на колоскових лусочках. Пізніше, під час дозрівання зерна, спостерігається почорніння зародка («чорний зародок»).
Збудник — недосконалий гриб Alternaria tenuis Fr. проникає усередину насіння, а його грибниця накопичується переважно в плодовій оболонці і тільки іноді досягає ендосперму.
Уражене зерно, як правило, велике, добре сформоване, чим відрізняється від ураженого гельмінтоспоріозом.
Значне поширення альтернаріоза буває в роки з високою температурою (вище +24°C) і вологістю повітря в період цвітіння пшениці і молочної спілості зерна.
Насіння, уражене альтернаріозом, фізіологічно недорозвинені. Вони мають низьку енергію проростання і схожість. Рослини, вирощені з такого насіння, відстають у рості та розвитку, унаслідок чого знижується врожайність.
Борошно з зерна з «чорним зародком» мають темнуватий колір і низькі хлібопекарські якості.